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以盛雲劾為首的億兵部隊蛇尾，相較於地球聯合和札多，他們接受的是立場中立的任務。儘管地球聯合與殖民地之聞簽署了停戦協議，但是戰爭卻沒有在世界上消失。因此，向蛇尾委託的任務也從末停止過。即使看起來是不可能的任務，他們也能輕易地完成，因此同業的傭兵中擁有相當高的評價，誰都會避免與他們戰鬥。在還樣的局劈下，積極地與蛇尾敵射的傭兵二人組登場。他們的目標，就只有身為首領的罷雲劾！
機動戰士高達 SEED DESTINY ASTRAY是機動戰士高達 SEED ASTRAY的續編，同樣連載於「月刊Gundam ace」（漫畫），「The Sneaker」（小說），「電擊HOBBY MAGAZINE」（情景模型小說）。
機動戰士高達 SEED DESTINY ASTRAY以機動戰士高達 SEED與機動戰士高達 SEED DESTINY之間約2年作為主要的舞台，本作亦會說明機動戰士高達 SEED DESTINY中不被描寫的背景故事。
故事開始在前次大戰結束後，地球圈似乎進入和平時期，但在暗中仍有許多不為人知的行動。攝影記者傑斯在一次採訪中遇到了朗·加路，並從他手中得到了迷惘高達非規格機（ASTRAY OUTFRAME）。以追求與傳達真實為目的的傑斯，駕着非規格機奔馳在各處，為了自己的理念而奮戰。